作品介紹

生命科學(xué)實(shí)驗(yàn)指南系列


作者:孫嘯 謝建明 周慶 等      整理日期:2021-07-14 14:56:12

  POD產(chǎn)品說(shuō)明:1. 本產(chǎn)品為按需印刷(POD)圖書(shū),實(shí)行先付款,后印刷的流程。您在頁(yè)面購(gòu)買且完成支付后,訂單轉(zhuǎn)交出版社。出版社根據(jù)您的訂單采用數(shù)字印刷的方式,單獨(dú)為您印制該圖書(shū),屬于定制產(chǎn)品。2. 按需印刷的圖書(shū)裝幀均為平裝書(shū)(含原為精裝的圖書(shū))。由于印刷工藝、彩墨的批次不同,顏色會(huì)與老版本略有差異,但通常會(huì)比老版本的顏色更準(zhǔn)確。原書(shū)內(nèi)容含彩圖的,統(tǒng)一變成黑白圖,原書(shū)含光盤的,統(tǒng)一無(wú)法提供光盤。3. 按需印刷的圖書(shū)制作成本高于傳統(tǒng)的單本成本,因此售價(jià)高于原書(shū)定價(jià)。4. 按需印刷的圖書(shū),出版社生產(chǎn)周期一般為15個(gè)工作日(特殊情況除外)。請(qǐng)您耐心等待。5. 按需印刷的圖書(shū),屬于定制產(chǎn)品,不可取消訂單,無(wú)質(zhì)量問(wèn)題不支持退貨。【編輯推薦】POD產(chǎn)品說(shuō)明:1. 本產(chǎn)品為按需印刷(POD)圖書(shū),實(shí)行先付款,后印刷的流程。您在頁(yè)面購(gòu)買且完成支付后,訂單轉(zhuǎn)交出版社。出版社根據(jù)您的訂單采用數(shù)字印刷的方式,單獨(dú)為您印制該圖書(shū),屬于定制產(chǎn)品。2. 按需印刷的圖書(shū)裝幀均為平裝書(shū)(含原為精裝的圖書(shū))。由于印刷工藝、彩墨的批次不同,顏色會(huì)與老版本略有差異,但通常會(huì)比老版本的顏色更準(zhǔn)確。原書(shū)內(nèi)容含彩圖的,統(tǒng)一變成黑白圖,原書(shū)含光盤的,統(tǒng)一無(wú)法提供光盤。3. 按需印刷的圖書(shū)制作成本高于傳統(tǒng)的單本成本,因此售價(jià)高于原書(shū)定價(jià)。4. 按需印刷的圖書(shū),出版社生產(chǎn)周期一般為15個(gè)工作日(特殊情況除外)。請(qǐng)您耐心等待。5. 按需印刷的圖書(shū),屬于定制產(chǎn)品,不可取消訂單,無(wú)質(zhì)量問(wèn)題不支持退貨。【編輯推薦】新定價(jià)鏈接:R語(yǔ)言及Bioconductor在基因組分析中的應(yīng)用從事統(tǒng)計(jì)分析或者生物信息學(xué)研究的工作人員和研究生,另外一類讀者是其他領(lǐng)域的計(jì)算機(jī)應(yīng)用人員【內(nèi)容簡(jiǎn)介】本書(shū)是國(guó)內(nèi)*本系統(tǒng)介紹R語(yǔ)言及Bioconductor軟件包的圖書(shū)。R是一種計(jì)算機(jī)程序設(shè)計(jì)語(yǔ)言,也是一個(gè)開(kāi)放式的軟件開(kāi)發(fā)平臺(tái)。R具有強(qiáng)大的數(shù)學(xué)統(tǒng)計(jì)分析和科學(xué)數(shù)據(jù)可視化功能,提供各種數(shù)據(jù)處理、統(tǒng)計(jì)分析及圖形顯示工具。軟件研究人員可以在R這個(gè)開(kāi)放平臺(tái)上不斷擴(kuò)充R的功能,開(kāi)發(fā)出面向特定應(yīng)用的軟件。Bioconductor就是一個(gè)基于R的、面向基因組信息分析的應(yīng)用軟件集合。Bioconductor的應(yīng)用功能主要是以包的集成形式呈現(xiàn)在用戶面前,它提供的軟件包中包括各種基因組數(shù)據(jù)分析和注釋工具,其中大多數(shù)工具是針對(duì)基因芯片或DNA微陣列數(shù)據(jù)的處理、分析、注釋及可視化。同時(shí),Bioconductor還提供許多與DNA微陣列相關(guān)的數(shù)據(jù)包。本書(shū)分為上下兩篇,分別介紹R和Bioconductor軟件包,介紹Bioconductor在基因組分析中應(yīng)用。【目錄】前言上篇 R語(yǔ)言第1章 R語(yǔ)言簡(jiǎn)介1.1 平臺(tái)1.2 R語(yǔ)言的發(fā)展簡(jiǎn)史1.3 R語(yǔ)言和統(tǒng)計(jì)學(xué)1.4 運(yùn)行R語(yǔ)言的環(huán)境及安裝1.5 交互式使用R語(yǔ)言第2章 R語(yǔ)言的基本數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)2.1 向量的賦值2.2 向量的基本運(yùn)算2.3 構(gòu)造向量2.4 邏輯向量2.5 字符向量2.6 復(fù)數(shù)向量2.7 獲取向量子集和修正向量子集2.8 常量第3章 R語(yǔ)言對(duì)象3.1 對(duì)象的基本屬性3.2 改變對(duì)象的長(zhǎng)度3.3 獲取對(duì)象的屬性3.4 獲取對(duì)象類第4章 分組因子4.1 分組因子4.2 聚集計(jì)算4.3 排序第5章 數(shù)組和矩陣5.1 定義數(shù)組5.2 數(shù)組子集操作5.3 構(gòu)造數(shù)組5.4 數(shù)組計(jì)算5.5 矩陣5.6 數(shù)組矩陣合并5.7 定義數(shù)組的操作第6章 數(shù)據(jù)列表和數(shù)據(jù)單6.1 數(shù)據(jù)列表6.2 構(gòu)造數(shù)據(jù)列表6.3 數(shù)據(jù)列表操作6.4 數(shù)據(jù)單第7章 導(dǎo)入導(dǎo)出數(shù)據(jù)7.1 高級(jí)函數(shù)7.2 低級(jí)函數(shù)7.3 命令臺(tái)輸入輸出以及格式化7.4 使用R語(yǔ)言內(nèi)含的數(shù)據(jù)集第8章 組合表達(dá)式和控制語(yǔ)句8.1 組合表達(dá)式8.2 控制語(yǔ)句第9章 函數(shù)9.1 排序的例子9.2 定義新的操作符9.3 參數(shù)名和參數(shù)缺省定義9.4 ‘...’形式的參數(shù)(虛參)9.5 函數(shù)和變量的作用范圍9.6 類、通用函數(shù)和面向?qū)ο?br />9.7 調(diào)試9.8 操作符號(hào)的優(yōu)先級(jí)第10章 包10.1 標(biāo)準(zhǔn)包10.2 擴(kuò)展包和CRAN10.3 包命名空間10.4 R語(yǔ)言中常用的包第11章 R語(yǔ)言中的統(tǒng)計(jì)11.1 R語(yǔ)言中的概率分布11.2 從離散數(shù)據(jù)集分析概率分布特性11.3 回歸分析第12章 圖形函數(shù)12.1 高級(jí)圖形命令12.2 低級(jí)圖形函數(shù)12.3 與圖形進(jìn)行交互12.4 利用圖形參數(shù)12.5 圖形參數(shù)列表12.6 設(shè)備驅(qū)動(dòng)12.7 動(dòng)態(tài)圖形下篇 Bioconductor及其應(yīng)用第13章 Bioconductor與DNA微陣列數(shù)據(jù)處理13.1 Bioconductor簡(jiǎn)介13.2 DNA微陣列13.3 微陣列數(shù)據(jù)處理與分析13.4 Bioconductor開(kāi)發(fā)背景13.5 Bioconductor各種包的分類介紹第14章 Bioconductor的使用14.1 Bioconductor的獲取和安裝14.2 Bioconductor快速入門14.3 Bioconductor應(yīng)用實(shí)例第15章 數(shù)據(jù)庫(kù)訪問(wèn)15.1 Rdbi軟件包15.2 RdbiPgSQL軟件包15.3 SAGElyzer軟件包第16章 圖形及用戶接口16.1 widget Tools包16.2 tk Widgets包16.3 geneplotter包16.4 hexbin包16.5 limma GUI包16.6 affylm GUI包16.7 webbioc包第17章 圖結(jié)構(gòu)17.1 graph包17.2 RGBL包17.3 Rgraphviz包17.4 SNAData數(shù)據(jù)包第18章 通用工具18.1 repos Tools包18.2 Biobase包18.3 Biostrings包18.4 DynDoc包18.5 Ruuid包18.6 ctc包18.7 convert包18.8 Icens包18.9 expr External和external Vector軟件包第19章 注釋19.1 annotate包19.2 AnnBuilder包19.3 Resourcer包19.4 SNPtools包19.5 Data packages包第20章 基因本體學(xué)20.1 go Tools包20.2 onto Tools包20.3 GO stats包第21章 微陣列數(shù)據(jù)預(yù)處理21.1 affy包21.2 affycomp包21.3 affydata包21.4 affypdnn包21.5 affyPLM包21.6 gcrma包21.7 makecdfenv包21.8 annaffy包21.9 marray包21.10 matchprobes包21.11 vsn包第22章 數(shù)據(jù)分析22.1 daMA包22.2 edd包22.3 factDesign包22.4 genefilter包22.5 globaltest包22.6 gpls包22.7 multtest包22.8 pamr包22.9 Measurement Error.cor包22.10 limma包22.11 ROC包22.12 siggenes包22.13 splicegear包22.14 RMAGEML包第23章 微陣列比較基因組雜交23.1 aCGH包23.2 DNAcopy包第24章 蛋白質(zhì)組學(xué)24.1 PROcess包24.2 gpls包24.3 apComplex包主要參考文獻(xiàn)附錄 R語(yǔ)言常用功能一覽表





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