主角以及一行眾人乘坐這未知空間公司的飛船前往比鄰星開發(fā)資源，在冥王星附近不幸遇到了黑洞，被黑洞傳送到了另外一個平行宇宙。
一行人掉落在某個不知名的行星上，在冒險途中，主角為了救潘詩文，被鐵皮盒子一路追殺，不幸掉落到山谷中，在山谷中的某處山洞里，發(fā)現(xiàn)了哈邁人留下的遺跡，并根據(jù)綠寶石的指引找到了最后幸存的哈邁人的意識。
經(jīng)過一系列的冒險與挫折，加上宇宙之眼的蠱惑，主角的意志發(fā)生了動搖。最終同伴的犧牲讓主角重拾斗志，通過探索各個平行宇宙，找回了所有阿特拉斯的克隆體，主角獲取了他們的能量，最終阻止了阿特拉斯的計劃。
