《日本陽明學(xué)派之哲學(xué)》中收錄的《釋明教育敕語衍義》主要由四部分構(gòu)成，**部分緒言，說明《教育敕語》頒發(fā)的經(jīng)過與原委；第二部分影印《敕語衍義》全篇；第三部分釋明，這一部分是核心部分，是在《教育敕語》頒布半個世紀之后的新的歷史時期，重新為其護教與辯誣，并賦予其新的歷史意義；第四部分《附錄道體論之概觀》也很重要，是要為日本的國體觀念從哲學(xué)上尋求"道體論"的思想根據(jù)。
《日本陽明學(xué)派之哲學(xué)》（1900年）與《日本古學(xué)派之哲學(xué)》（1902年）、《日本朱子學(xué)派之哲學(xué)》（1905年）被稱為井上“儒學(xué)三部曲”，是近代日本儒學(xué)史的奠基性著作。
《日本陽明學(xué)派之哲學(xué)》是井上哲次郎“儒學(xué)三部曲”中早問世之作，主要分為中江藤樹及藤樹學(xué)派、藤樹蕃山以后的陽明學(xué)派、大鹽中齋及中齋學(xué)派、中齋以后的陽明學(xué)派四篇，不僅對有代表性的思想家的事跡、著作、學(xué)說等進行了細致的論述，而且從日本思想史的發(fā)展進程中系統(tǒng)梳理出了陽陰學(xué)派的譜系，這種學(xué)派劃分與學(xué)說整理方式作為近代日本儒學(xué)研究的范式，其學(xué)術(shù)史上的示范意義，在今天依然具有強大的影響力。
《日本陽明學(xué)派之哲學(xué)》特別重視闡發(fā)陽明學(xué)者的道德思想，旨在批判當時盛行的功利主義和利己主義思想。為國民道德建設(shè)服務(wù)，也是日本近代思想史發(fā)展脈絡(luò)上的重要標記。
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